Laborjournal 2018-10

NEBNext Single Cell/Low Input RNA Library Prep Kit Mit diesem neuen Kit generieren Sie hochqualitative „full-length transcript sequencing libraries“ aus einzelnen Zellen (oder 2 pg – 200 ng total RNA). • Sie detektieren deutlich mehr Transkripte inkl. „low abundance transcripts“ • Sie erhalten eine uniforme Coverage mit „full-length“ Transkripten, unabhängig von Menge, Quelle oder GC-Gehalt der eingesetzten RNA • Sie sparen Zeit und Ausgangsmaterial durch ein „single-tube“ Protokoll von Zelllyse bis zur cDNA sowie der „one-step“ Reaktion aus kombinierter enzymatischer DNA Fragmentierung, end-repair und d(A)-tailing How low can you go? One or more of these products are covered by patents, trademarks and/or copyrights owned or controlled by New England Biolabs, Inc. For more information, please email us at gbd@neb.com. The use of these products may require you to obtain additional third party intellectual property rights for certain applications. ILLUMINA ® , NEXT-SEQ ® and NEXTERA ® are registered trademarks of Illumina, Inc. SMART-SEQ ® and ULTRA ® are registered trademarks of Takara Bio, Inc © Copyright 2018, New England Biolabs, Inc.; all rights reserved. Mit dem NEBNext Single Cell/Low Input RNA Library Prep Kit detektieren Sie mehr seltene Transkripte Sequencing libraries von Jurkat Einzelzellen (6 Replikate) wurden mit dem NEBNext Single Cell/ Low Input RNA Library Prep Kit, bzw. dem SMART-Seq ® v4 Ultra ® Low Input RNA Kit for Sequencing in Kombination mit dem Nextera ® XT DNA Library Prep Kit angefertigt und auf einem Illumina ® NextSeq ® 500 sequenziert. Jeder Punkt der Abbildung repräsentiert die Anzahl an Transkripten im entsprechenden Transcripts Per Kilobase Million (TPM) Bereich; jede Box gibt den Median, sowie das 1. und 3. Quartil pro Replikat und Methode wieder. Zum Read Mapping und Quantifizierung aller GENCODE v25 Transkripte wurde Salmon 0.6 verwendet. Mit den NEBNext Libraries wurden deutlich mehr „low abundance transcripts“ identifiziert. Bestellen Sie Ihr Testmuster noch heute unter: www.neb-online.de/SingleCell 1: NEBNext ® Kit 2: SMART-Seq ® v4/Nextera ® XT Number of Transcripts 0 500 1000 1500 2000 2500 3000 3500 4000 4500 1 2 1–5 TPM 0 500 1000 1500 2000 2500 3000 1 2 5–10 TPM 0 1000 2000 3000 4000 5000 6000 7000 1 2 10–50 TPM 0 500 1000 1500 2000 2500 3000 3500 1 2 >50 TPM INSPIRED DISCOVERY GENUINE be drive stay

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